相关文章
Related Articles详细介绍
一、PM小鼠模型构建技术路线选择
方法 | 周期 | 精度 | 适用场景 |
CRISPR-Base Editing | 2-3个月 | 单碱基 | C→T或A→G转换(无需DSB) |
CRISPR-HDR | 3-5个月 | 任意突变 | 需设计ssODN供体 |
ES细胞同源重组 | 6-12个月 | 最高 | 复杂突变(如大片段替换+点突变) |
二、PM小鼠模型构建CRISPR-HDR方案(当前常用)
1. 靶点设计与工具选择
gRNA设计:
靶向突变位点附近(距离<10 bp),使用Benchling优化特异性。
推荐工具:
单碱基编辑:ABE8e(A→G)或BE4max(C→T)编辑器。
HDR修复:高保真Cas9(如HiFi Cas9) + 化学修饰ssODN供体。
2. ssODN供体设计
5'同源臂 40-60nt
目标突变+沉默突变*
3'同源臂 40-60nt
沉默突变:在PAM序列或gRNA靶区引入1-2 bp沉默突变(防止供体重切)。
化学修饰:3'端硫代磷酸酯化(增强稳定性,IDT可合成)。
3. 受精卵注射
注射混合物:
Cas9 mRNA (50 ng/μL) + gRNA (25 ng/μL) + ssODN (100 ng/μL)。
胚胎处理:
注射后培养至囊胚期,移植至假孕母鼠。
4. 基因型鉴定
初筛PCR:扩增含突变位点的片段(引物距突变位点>50 bp)。
深度测序:
使用ICE工具分析NGS数据,计算HDR效率。
敏感方法:ddPCR检测低频突变(<1%)。
5. 品系建立与验证
传代验证:F0可能为嵌合体,需与野生型交配获得稳定遗传。
功能验证:
蛋白质印迹(检测突变蛋白表达)。
酶活检测(如代谢酶突变需测活性)。
三、ES细胞打靶方案(超高精度)
1. 靶向载体构建
同源臂设计:5'和3'臂各1.5-2 kb,中间含目标突变。
筛选标记:
正选择:NeoR(后续可通过Flp删除)。
负选择:DTA(减少随机整合)。
2. ES细胞筛选与验证
阳性克隆鉴定:
长片段PCR(扩增整个重组区域)。
Sanger测序确认突变位点。
3. 小鼠制备
通过囊胚注射获得嵌合体,与Flp deleter小鼠交配删除NeoR。
四、Base Editing方案(无DSB风险)
1. 系统选择
C→T突变:用BE4max + gRNA(靶向C在窗口4-8位)。
A→G突变:用ABE8e + gRNA(靶向A在窗口4-7位)。
2. 效率优化
注射浓度:
BE4max mRNA (100 ng/μL) + gRNA (50 ng/μL)。
胚胎基因型:
需检测旁系编辑(预测工具:BE-Hive)。
五、经典案例解析
突变类型 | 疾病模型 | 构建方法 |
BRAF V600E | 黑色素瘤 | CRISPR-HDR + ssODN |
TP53 R175H | Li-Fraumeni综合征 | ES细胞同源重组 |
CFTR ΔF508 | 囊性纤维化 | Base Editing (C→T) |
六、常见问题与解决
问题 | 原因 | 解决方案 |
HDR效率低 | ssODN稳定性不足 | 使用硫代磷酸酯修饰ssODN |
嵌合体突变丢失 | 生殖系未传递 | 增加F0交配数量,筛选生殖系传递后代 |
非预期旁系突变 | Base Editing脱靶 | 选择高特异性gRNA,验证全基因组脱靶 |
产品咨询